種子發芽試驗資料的統計分析模型 - Airiti Library華藝線上圖書館

在種子發芽試驗裡，種子發芽時間長短常常受到溫度及光照等環境因素的影響，甚至導致部分種子進入休眠狀態，所以假設種子在未來時間裡全部一定都會發芽是不合理的，另一 ... 隨時查．隨時看，你的隨身圖書館已上線! 立即使用 DOI 是數位物件識別碼 （ D igital O bject I dentifier ） 的簡稱， 為物件在網路上的唯一識別碼，可用於永久連結並引用目標物件。

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來源資料 臺灣大學農藝學研究所學位論文 碩士班/2017年 不同生長條件對台灣藜幼苗機能性成分之影響 應用廣義成分方法於高維度平均值對等性檢定 模擬探討基因體選種在水稻育種計畫中之運用 本質相關係數套件cidr及其應用-以找尋阿拉伯芥非生物逆境專一之基因群為例 光質對桃葉斑鳩菊(Vernoniaamygdalina)之光生理與抗氧化能力影響 SlMYB94轉殖基因對番茄花器長度的影響評估 以線性模型與時間序列分析建立雲林縣落花生產量預測模型 利用分子標誌建立玉米單倍體鑑定技術 低鹽味噌抗菌及抗氧化性之研究 種子發芽試驗資料的統計分析模型 生物資源暨農學院 > 農藝學研究所 生物農學 > 農業 書目管理工具 書目匯出 加入收藏 加入購物車 E-mail給朋友 列印書目 相關連結 問題回報 購買單篇 全文下載 種子發芽試驗資料的統計分析模型 StatisticalAnalysisofSeedGerminationDatafromAgriculturalExperiments 何漢坤 ,碩士　　指導教授：蔡政安　　 繁體中文 DOI： 10.6342/NTU201701840 存活分析；種子試驗；治癒模式；最大概似估計法；馬可夫鏈-蒙地卡羅；Survivalanalysis；seedgerminationassays；curemodel；maximumlikelihood；MarkovChain-MonteCarlo 分享到 摘要 │ 參考文獻 (15) │ 文章國際計量 摘要 〈TOP〉 在種子發芽試驗裡，種子發芽時間長短常常受到溫度及光照等環境因素的影響，甚至導致部分種子進入休眠狀態，所以假設種子在未來時間裡全部一定都會發芽是不合理的，另一方面，由於記錄種子發芽的時間點都是間斷的和有限的，因此常見的數據型態為右設限資料和區間設限資料，綜合以上兩點因素，可以使用存活分析(survivalanalysis)裡的治癒模型(curemodel)來分析這類事件發生所需時間(time-to-event)的資料。

在醫學研究中，醫師通常對於某特定或有興趣的疾病想要去研究它，會在一段時間內去觀察被實驗的對象有沒有發生事件(即被實驗的對象有沒有發生有興趣研究的疾病)，但實際狀況裡，被實驗的對象又可包含了對疾病免疫的人，即使觀察時間拉的很長，對於這些免疫的人，還是不會發病，而存活分析裡的混合的治癒模式(mixturecuremodel)，建構的特色就是對於疾病免疫者在模式裡假設有一部分治癒的比例，再針對非免疫者的發病時間假設服從一個合理的機率分配,所形成的混合模式。

本篇文章主要在治癒模式的架構之下，進一步考慮溫度對於種子休眠比例和發芽時間的影響，並以不同的統計方法，包括最大概似估計法(MLE)和馬可夫鏈-蒙地卡羅(MCMC)估計法來估計模式裡的未知參數。

我們透過模擬研究來比較不同種子發芽模式下參數估計的結果，並以不偏性、標準誤、均方差及區間估計覆蓋率來比較不同的估計方法的好壞。

最後，我們使用R裡〝drc〞這個套件裡的小麥、綠豆、水稻實際種子發芽資料來進行最大概似估計法和馬可夫鏈-蒙地卡羅估計法的比較。

並列摘要 〈TOP〉 Intheseedgerminationandemergenceassays,onefundamentalquestionishowtomeasuretheeffectofexperimentalfactorsontheprocessofgerminationandemergence.Germinatingtimeisoftenaffectedbyenvironmentalfactorssuchastemperatureandlight,evenleadseedstodormant.Itisunrealistictoassumethatallseedswillgerminateinthefuture.Sinceinspectiontimesarefiniteandintermittent,thedatatypeareconsideredasright-censoreddataandinterval-censoreddata.Therefore,wecanusethecuremodelinthesurvivalanalysistoanalyzethiskindoftime-to-eventdata. Inmedicalresearch,physiciansusuallywanttostudyaparticularorinterestingdiseaseandobserveexperimentalunitsforaperiodoftime.Inreality,somepatientsmaybeimmunizedagainstthedisease.Evenifthemonitoringtimeislongenough,theimmunepersonisstillnotsick.Themajorcharacteristicofmixedcuremodelinsurvivalanalysisisthatthereisacuredfractioninthemodelandthetimeofonsetofnon-immunizedpeopleisassumedtobeareasonableprobabilitydistribution.Thisisthemixedcuremodel. Inthispaper,theeffectsoftemperatureonthedormancyratioandgerminatingtimeweremainlyconsideredundertheframeworkofthecuremodel.Themaximumlikelihoodestimation(MLE)andMarkovChainMonteCarlo(MCMC)areusedtoestimatetheunknownparametersinthemodel.Wecomparetheresultsofparameterestimationwithdifferentmodelsthroughsimulationstudies,andcomparetheperformancesofdifferentestimationmethodsintermsofbias,standarderror,meansquareerrorandcoverageprobability.Inaddition,weusethedataofwheat,mungbean,andriceinthe"drc"packageofRtocomparethemaximumlikelihoodestimationandtheMarkovChainMonteCarloestimation. 參考文獻 ( 15 ) 〈TOP〉 1.Farewell,V.T.(1982).Theuseofmixturemodelsfortheanalysisofsurvivaldatawithlong-termsurvivors.Biometrics,38,1041-1046.連結： 2.Farewell,V.T.(1986).Mixturemodelsinsurvivalanalysis:Aretheyworththerisk?CanadianJournalofStatistics,14(3),257-262.連結： 3.Kiani,K.&Arasan,J.(2012).Simulationofintervalcensoreddatainmedicalandbiologicalstudies.InternationalJournalofModernPhysics,9,112-118.連結： 5.Maller,R.A.&Zhou,S.(1992).Estimatingtheproportionofimmunesinacensoredsample.Biometrika,79,731-739.連結： 6.Martinez,E.Z.,Achcar,J.A.,Jácome,A.A.&Santos,J.S.(2013).Mixtureandnon-mixturecurefractionmodelsbasedonthegeneralizedmodifiedWeibulldistributionwithanapplicationtogastriccancerdata.ComputerMethodsandProgramsinBiomedicine,112(3),343-355.連結： 文章國際計量 〈TOP〉 E-mail ： 文章公開取用時，將寄通知信至您填寫的信箱地址 E-mail ： 購物車中已有多篇文章，請問是否要先清除，或一併加入購物車中購買?